Vadovaujantis tvarkos aprašu, rašoma Aplinkos ministerijos pranešime, administratorius pildo nustatytos formos paraišką kredito įmokoms ir palūkanoms apmokėti (4 priedas) ir ją pateikia savivaldybės administracijai. Savivaldybės administracija, gavusi ir įvertinusi paraišką, per 10 darbo dienų apmoka kredito įmokas ir palūkanas už asmenis, turinčius teisę į būsto šildymo išlaidų kompensaciją, pervesdama atitinkamą sumą į paraiškoje nurodytą butų ir kitų patalpų savininkų kaupiamųjų lėšų sąskaitą.

Siekiant skaidraus ir sklandaus įmokų administravimo proceso, savivaldybės administracija pagal paraiškoje teikiamą informaciją turėtų atlikti atskirus mokėjimus už kiekvieną asmenį, turintį teisę į šildymo išlaidų kompensaciją. Atskiri mokėjimai turėtų būti atliekami ir tais atvejais, kuomet vienoje paraiškoje administratorius pateikia informaciją apie mokėtinas sumas už keletą asmenų, turinčių teisę į šildymo išlaidų kompensaciją.

Pervesdama apskaičiuotą kredito ir palūkanų sumą, savivaldybės administracija mokėjimo pavedime nurodo pavedimo paskirtį – kredito sutarties numerį, buto savininko, kuriam nustatyta teisė į kredito ir palūkanų apmokėjimą, vardą, pavardę arba buto ar kitos patalpos mokėtojo kodą, jam priskaičiuotą kredito ir palūkanų sumą.

Sklandžiam įmokų užskaitymui būtina, kad pavedimo paskirtyje būtų nurodytas mokėtojo kodas (jeigu toks yra suteiktas). Tuo tikslu administratoriai mokėtojo kodą turi nurodyti paraiškoje.

Tvarkos aprašo nuostatas, numatančias mokėjimo tvarką, artimiausiu metu planuojama keisti, tačiau, rašoma pranešime, tikimasi, kad aukščiau įvardintus prašymus pavyks įgyvendinti kaip įmanoma greičiau tam, kad įmokos būtų užskaitomos sklandžiai ir gyventojams nebūtų fiksuojami vėlavimai ir priskaičiuojami delspinigiai.

Prašoma pavedimus už butų ir kitų patalpų savininkus atlikti atskirais mokėjimais, nurodant mokėjimo paskirtyje mokėtojo kodą, jei tokį yra pateikęs administratorius.